重慶市人民醫院（重慶大學附屬人民醫院、重慶市醫學科學院）是重慶市首批“國家三級甲等醫院”。經重慶市政府批準，由原重慶市第三人民醫院、重慶市中山醫院合并組建，于2016年3月25日掛牌成立。醫院有兩江院本部、三院院區、中山院區（重慶市眼耳鼻咽喉科醫院），以及獨立區域的健康管理中心。2022年1月，重慶市醫學科學院成立。2023年9月，成為重慶大學附屬醫院。
重慶市人民醫院（重慶大學附屬人民醫院、重慶市醫學科學院）是重慶市首批“國家三級甲等醫院”。經重慶市政府批準，由原重慶市第三人民醫院、重慶市中山醫院合并組建，于2016年3月25日掛牌成立。醫院有兩江院本部、三院院區、中山院區（重慶市眼耳鼻咽喉科醫院），以及獨立區域的健康管理中心。2022年1月，重慶市醫學科學院成立。2023年9月，成為重慶大學附屬醫院。
附屬腫瘤醫院創建于1943年，是集醫療、教學、科研、預防、康復為一體的國家三級甲等腫瘤專科醫院，是國際抗癌聯盟（UICC）成員單位，國家癌癥區域醫療中心委市共建單位，國家區域中醫（腫瘤）診療中心建設單位。
附屬三峽醫院地處三峽庫區腹心——重慶市萬州區，始建于1929年，2020年1月成為重慶大學附屬三峽醫院。是集醫療、教學、科研、預防、保健為一體的、全國醫學學科設置最為齊全的大型綜合性三級甲等醫院，系全國文化醫院建設的引領者、全國醫院集團化發展的先行者、重慶市級區域醫療中心。
附屬中心醫院是以急危重癥與創傷救治為特色，集120指揮調度、醫療、教學、科研為一體的國家三甲綜合教學醫院。面向社會提供醫療服務，履行政府公共衛生救援及緊急醫學救援職能，承擔中心城區120指揮調度、日常急救任務。
附屬涪陵醫院建于1914年，2002年獲批國家三級甲等醫院，是集醫教研為一體的綜合性醫院，2022年3月正式獲批成為重慶大學直屬附屬醫院。醫院“一院三區”協同發展，總占地275畝，開放床位2200張，在崗職工2500余人。
附屬江津醫院始建于1939年，是一所集醫療、科研、教學、預防、保健、康復和醫學救援為一體的國家三級甲等綜合醫院，是重慶市首批公立醫院高質量發展試點醫院。醫院設本部和東門分院，占地面積共220畝，編制床位1000張，承擔著江津及周邊地區500多萬人口的衛生健康與疾病診治任務。
附屬黔江醫院是國家三級甲等綜合醫院，是市級區域醫療中心、國家住院醫師規范化培訓基地和醫師資格實踐技能考試基地。建筑面積21.8萬㎡，編制床位1500張，現有臨床醫技科室44個，重慶市重點（特色）學科、專科17個。
重慶大學附屬仁濟醫院（重慶市第五人民醫院）位于南濱路長嘉匯板塊，為三級甲等綜合醫院。建筑面積26.5萬平方米，規劃床位數1200張。現有職工1300余人，博士40余人，碩士260余人，高級職稱240余人，其中正高70余人、副高160余人。
附屬沙坪壩醫院始建于1939年，前身是重慶市第六診所，歷經80余年建設發展，現為一所集醫療、教學、科研、急救和保健為一體的國家三級綜合醫院（國家三級甲等教學綜合醫院創建工作已啟動），年門急診服務患者120萬余人次。
